computational and visualization techniques for structural bioinformatics using chimera

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Computational And Visualization Techniques For Structural Bioinformatics Using Chimera

Author : Forbes J. Burkowski
ISBN : 9781439836620
Genre : Science
File Size : 67. 14 MB
Format : PDF, ePub
Download : 906
Read : 1316

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A Step-by-Step Guide to Describing Biomolecular Structure Computational and Visualization Techniques for Structural Bioinformatics Using Chimera shows how to perform computations with Python scripts in the Chimera environment. It focuses on the three core areas needed to study structural bioinformatics: biochemistry, mathematics, and computation. Understand Important Concepts of Structural Bioinformatics The book covers topics that deal primarily with protein structure and includes many exercises that are grounded in biological problems at the molecular level. The text encourages mathematical analysis by providing a firm foundation for computations. It analyzes numerous Python scripts for the Chimera environment, with the scripts and other material available on a supplementary website. Build Python Scripts to Extend the Capabilities of Chimera Through more than 60 exercises that involve the development of Python scripts, the book gives you concrete guidance on using the scripting capabilities of Chimera. You’ll gain experience in solving real problems as well as understand the various applications of linear algebra. You can also use the scripts as starting points for the development of similar applications and use classes from the StructBio toolkit for computations, such as structure overlap, data plotting, scenographics, and display of residue networks.

Big Data Analysis For Bioinformatics And Biomedical Discoveries

Author : Shui Qing Ye
ISBN : 9781498724548
Genre : Mathematics
File Size : 32. 52 MB
Format : PDF, ePub
Download : 860
Read : 483

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Demystifies Biomedical and Biological Big Data Analyses Big Data Analysis for Bioinformatics and Biomedical Discoveries provides a practical guide to the nuts and bolts of Big Data, enabling you to quickly and effectively harness the power of Big Data to make groundbreaking biological discoveries, carry out translational medical research, and implement personalized genomic medicine. Contributing to the NIH Big Data to Knowledge (BD2K) initiative, the book enhances your computational and quantitative skills so that you can exploit the Big Data being generated in the current omics era. The book explores many significant topics of Big Data analyses in an easily understandable format. It describes popular tools and software for Big Data analyses and explains next-generation DNA sequencing data analyses. It also discusses comprehensive Big Data analyses of several major areas, including the integration of omics data, pharmacogenomics, electronic health record data, and drug discovery. Accessible to biologists, biomedical scientists, bioinformaticians, and computer data analysts, the book keeps complex mathematical deductions and jargon to a minimum. Each chapter includes a theoretical introduction, example applications, data analysis principles, step-by-step tutorials, and authoritative references.

Computational Exome And Genome Analysis

Author : Peter N. Robinson
ISBN : 9781498775991
Genre : Mathematics
File Size : 86. 76 MB
Format : PDF
Download : 861
Read : 1223

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Exome and genome sequencing are revolutionizing medical research and diagnostics, but the computational analysis of the data has become an extremely heterogeneous and often challenging area of bioinformatics. Computational Exome and Genome Analysis provides a practical introduction to all of the major areas in the field, enabling readers to develop a comprehensive understanding of the sequencing process and the entire computational analysis pipeline.

Kompendium Systembiologie

Author : Andreas Kremling
ISBN : 9783834886071
Genre : Science
File Size : 70. 85 MB
Format : PDF, ePub, Mobi
Download : 500
Read : 827

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Das Buch beschreibt die Grundlagen der mathematischen Modellierung zellulärer Systeme. Nach einer Klassifikation von Modellen wird schwerpunktmäßig auf deterministische Modelle eingegangen und für alle relevanten zellulären Prozesse entsprechende Gleichungen angegeben. Anschließend werden eine Reihe von Verfahren zur Modellanalyse vorgestellt. Etwas kürzer werden Verfahren zum Reverse Engineering und zur Analyse von Netzwerkgraphen abgehandelt. Am Ende werden noch Verfahren der Parameteridentifikation besprochen.

Das Gen

Author : Siddhartha Mukherjee
ISBN : 3596032350
Genre :
File Size : 76. 59 MB
Format : PDF, ePub, Mobi
Download : 999
Read : 915

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Gentechnologie F R Einsteiger

Author : T. A. Brown
ISBN : 3827428688
Genre : Science
File Size : 28. 84 MB
Format : PDF, ePub
Download : 643
Read : 748

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Gentechnologie für Einsteiger hat sich weltweit als leicht verständliche Einführung in dieses wichtige und spannende Wissenschaftsgebiet bewährt. Die sechste Auflage bleibt dem Grundkonzept früherer Auflagen treu, widmet sich aber auch neuen, wachsenden Forschungsfeldern. Das Buch bleibt damit ein unentbehrlicher Leitfaden für Studierende in den Biowissenschaften und ihren zahlreichen Teilgebieten. Es eignet sich auch bestens als Einführung für alle, die sich in ihrem Beruf mit den Grundlagen des Themas vertraut machen müssen.

Molekularbiologie Der Zelle

Author : Bruce Alberts
ISBN : 9783527323845
Genre : Cells
File Size : 54. 19 MB
Format : PDF, Mobi
Download : 347
Read : 566

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Seit einem Vierteljahrhundert ist 'Molekularbiologie der Zelle' das führende Lehrbuch im Bereich Zellbiologie. Diese erfolgreiche Tradition wird nun mit der fünften Auflage fortgesetzt, die vollständig überarbeitet und aktualisiert wurde. Mit zahlreichen inhaltlichen Neuerungen stellt sie unser aktuelles, sich rasch weiterentwickelndes Wissens zum zentralen Gegenstand der Biologie dar - der Zelle.

Entropie Und Wahrscheinlichkeit

Author : Ludwig Boltzmann
ISBN : 3808555041
Genre : Entropy
File Size : 84. 19 MB
Format : PDF, Mobi
Download : 786
Read : 786

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Molekulare Zellbiologie

Author : Arnold Berk
ISBN : 9783110810578
Genre : Science
File Size : 87. 24 MB
Format : PDF, ePub
Download : 716
Read : 176

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Theorie Der Neuronalen Netze

Author : Raul Rojas
ISBN : 9783642612312
Genre : Computers
File Size : 82. 27 MB
Format : PDF, Kindle
Download : 883
Read : 857

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Neuronale Netze sind ein Berechenbarkeitsparadigma, das in der Informatik zunehmende Beachtung findet. In diesem Buch werden theoretische Ansätze und Modelle, die in der Literatur verstreut sind, zu einer modellübergreifenden Theorie der künstlichen neuronalen Netze zusammengefügt. Mit ständigem Blick auf die Biologie wird - ausgehend von einfachsten Netzen - gezeigt, wie sich die Eigenschaften der Modelle verändern, wenn allgemeinere Berechnungselemente und Netztopologien eingeführt werden. Jedes Kapitel enthält Beispiele und ist ausführlich illustriert und durch bibliographische Anmerkungen abgerundet. Das Buch richtet sich an Leser, die sich einen Überblick verschaffen oder vorhandene Kenntnisse vertiefen wollen. Es ist als Grundlage für Neuroinformatikvorlesungen an deutschsprachigen Universitäten geeignet.

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